Infect-ERA - Europäische Förderung von Infektionskrankheiten-Forschung

Teilprojekt Münster

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - ERASE: Speziesübergreifende Evaluierung viraler RNA und DNA bindender Proteine

Viren sind die auf der Welt am stärksten verbreiteten Krankheitserreger. Von ihnen verursachte Krankheiten gehören zu den häufigsten Todesursachen beim Menschen. Die Erkennung einer Infektion durch das menschliche Immunsystem anhand von zelleigenen Proteinen ist von fundamentaler Bedeutung, damit das angeborene Immunsystem Viren abwehren kann. Während der letzten Jahre ist unser Wissen über die zelluläre Erkennung viraler Infektionen enorm gewachsen. Meistens werden dazu zelluläre Proteine genutzt, die virale Erbinformationen (RNA und DNA) selektiv aufspüren.
In diesem internationalen Verbundprojekt mit Beteiligung von Arbeitsgruppen aus Deutschland, Österreich, Dänemark und Frankreich soll das Repertoire von zellulären Proteinen, das virale Erbinformationen bindet, identifiziert werden. Zudem soll evaluiert werden, ob diese Proteine auch antivirale Funktionen besitzen. Da das angeborene Immunsystem zwischen verschiedenen Spezies sehr vergleichbar ist, sind Analysen zur Identifikation und zur funktionellen Charakterisierung im Immunsystem der Fliege bis zum Menschen Bestandteil des Vorhabens. Es wird erwartet, dass durch diese Analysemethode Proteine für neue antivirale Therapien beim Menschen gefunden werden.

Teilprojekt Planegg-Martinsried I

Teilprojekt Planegg-Martinsried II

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - eDEVILLI: Protein Interaktionen von Zytomegalievirus Genomen“

Im Verbundprojekt eDEVILLI wird die Infektionskrankheit Herpes näher erforscht. Eine Herpesinfektion wird durch Viren hervorgerufen. Nach einer Ansteckung mit dem Herpesvirus kommt es nicht in jedem Fall sofort zu einem Krankheitsausbruch. Stattdessen kann das Herpesvirus auch in einen sogenannten Ruhezustand verfallen und erst zu einem späteren Zeitpunkt Herpes auslösen. Bis heute ist nicht klar, warum Herpesviren plötzlich wieder aktiv werden. Bei Menschen, deren Immunsystem durch Medikamente unterdrückt wird (z.B. bei Transplantat-Empfängern oder Menschen mit HIV), können Herpesviren, die aus dem Ruhezustand erwachen, lebensbedrohliche Krankheiten verursachen.
Jede einzelne von einem Herpesvirus infizierte Zelle entscheidet sich in den ersten Stunden nach der Infektion, ob sie sofort Herpes auslöst oder in den Ruhezustand geht. Bisher konnte dieser Entscheidungsmechanismus noch nicht entschlüsselt werden. Das internationale Forschungsprojekt eDEVILLI, an dem sich Arbeitsgruppen aus Deutschland, Österreich, Frankreich und Schweden beteiligen, soll dies ändern und wird dabei sowohl die molekularen Mechanismen dieser Entscheidung untersuchen, als auch neue Therapiekonzepte zur Bekämpfung der Herpesviren liefern.

Teilprojekt Braunschweig

Teilprojekt Würzburg

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - AMOEBAC: Analyse der Interaktion von Entamoeba histolytica und Bakterien in der intestinalen Pathogenese“

Im Verbundprojekt AMOEBAC sollen die Amöbenruhr näher untersucht und neue Behandlungsstrategien etabliert werden. Die Amöbenruhr wird von einem Wechseltierchen (der Amöbe Entamoeba histolytica) verursacht, das im menschlichen Dickdarm lebt. Infektionen, die durch diesen Parasiten ausgelöst werden, stellen weltweit eine Herausforderung für die Gesundheitssysteme dar. Nach Angaben der WHO leiden über 50 Millionen Menschen an der Amöbenruhr, ca. 100.000 Menschen sterben jährlich daran. Insbesondere Entwicklungsländer sind sehr stark betroffen. Impfstoffe gegen diese Infektionskrankheit sind nicht verfügbar und die Anwendung von vorhandenen Medikamenten ist mit Nebenwirkungen und der Ausbildung von Resistenzen verbunden.
Das internationale Verbundprojekt, mit Beteiligung von Forschungsgruppen aus Deutschland, Israel, Frankreich und Indien, zielt darauf ab, die Infektionsvorgänge bei der Amöbenruhr besser zu verstehen. Dabei soll insbesondere die Wechselwirkung der krankmachenden Amöben mit der natürlichen bakteriellen Darmflora auf molekularer Ebene näher untersucht werden. Hierfür sind sowohl die Anwendung sogenannter Metabolomics-Methoden als auch biochemische und analytische Herangehensweisen vorgesehen. Das deutsche Teilprojekt ist dabei insbesondere für die Bearbeitung der Metabolom-Analysen zuständig; dadurch sollen vertiefende Einblicke in die Zellphysiologie der verschiedenen beteiligten Bakterien gewonnen werden.

Teilprojekt Greifswald

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - CampyRNA: Untersuchung von regulatorischen RNAs in den frühen Phasen von Campylobacter Infektionen“

Im Verbundprojekt CampyRNA werden Infektionen mit Bakterien, die zu Lebensmittel-vergiftungen führen – genauer gesagt die Wechselwirkung von Krankheitserreger und Wirt – näher untersucht. Sobald ein bakterieller Krankheitserreger einen Wirt infiziert, kommt es zu einer „Antwort“ durch den infizierten Wirt. Aktuelle Forschungsergebnisse weisen darauf hin, dass dabei auf beiden Seiten sogenannte nicht-kodierende RNAs (ncRNAs) eine wichtige Rolle spielen: Auf der bakteriellen Seite handelt es sich dabei um kleine regulatorische RNAs (sRNAs), die dem Bakterium bei der Kontrolle von Stressantwort-Genen des Wirtes oder der Virulenz dienen. Auf der Wirtsseite wiederum sind es MikroRNAs (miRNAs), denen im Verlauf bakterieller Infektionen eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Signalwege der körpereigenen Immunantwort zukommt.
Zur näheren Erforschung dieser Zusammenhänge kommt im diesem Verbundprojekt als Modellorganismus das Bakterium Campylobacter jejuni zum Einsatz, das zurzeit die häufigste Ursache bakterieller Lebensmittelvergiftungen darstellt. Der Schwerpunkt der Untersuchungen liegt in der Anfangsphase einer Infektion: Hier soll die Rolle sowohl von bakterieller als auch von Wirts-ncRNAs näher erforscht werden. In einem internationalem Konsortium mit Forschungsgruppen aus Frankreich und Portugal konzentriert sich Teilprojekt Würzburg I auf die Identifizierung und funktionale Charakterisierung der bakteriellen sRNAs, wobei Teilprojekt Würzburg II vergleichbare Untersuchungen an den Wirtszell-miRNAs durchführt.
Das Verbundprojekt kann langfristig neue Einblicke, Perspektiven sowie Technologien für die Untersuchung des Zusammenspiels von Krankheitserreger und Wirtszelle liefern, die zukünftig dann auch auf andere Krankheitserreger angewendet werden können.

Teilprojekt Würzburg I

Teilprojekt Würzburg II

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - ESCential: Haploide embryonalen Stammzellen zur Identifizierung von Wirtsfaktoren hochpathogener RNA-Viren“

Im Verbundprojekt ESCential soll das Rift-Valley-Fever-Virus (RVF-Virus), das in Afrika verheerende Epidemien verursacht, näher untersucht werden. Das RVF-Virus kann beim Menschen eine infektiöse – im Extremfall tödliche – Fiebererkrankung auslösen. Bei Nutztieren führt eine Infektion durch den Tod von jungen oder trächtigen Tieren zu enormen wirtschaftliche Schäden. Obwohl das RVF-Virus als potenzielle biologische Waffe klassifiziert ist, existieren keine zugelassenen Mittel zur Therapie. Wie alle Viren benötigt auch das RVF-Virus einen Wirtsfaktor als Helfer. Die Aufklärung der für das RVF-Virus lebenswichtigen Wirtsfaktoren und die Erkenntnisse darüber, welcher Infektionsschritt des RVF-Virus von welchem Wirtsfaktor abhängt, könnten zur Identifizierung möglicher anti-viraler Wirkstoffe gegen das RVF-Virus führen.
Ziel des Verbundprojektes ist es daher, solche Helfer, von denen die Vermehrung des Virus abhängt, zu identifizieren, die Wirkweise zu verstehen und Therapieansätze zu finden. Im internationalen Konsortium mit Partnern aus Belgien, Österreich und Schweden arbeitet das deutsche Teilprojekt an embryonalen Maus-Stammzellen; diese werden mit dem Virus infiziert. Anschließend wird nach Zellklonen gesucht, die gegen eine Infektion mit dem RVF-Virus resistent sind. Die resistenten Zellklone haben mit hoher Wahrscheinlichkeit eine Mutation in einem für das RVF-Virus wichtigen Gen. Diese Zellklone werden dann mit den anderen Verbundpartnern weiter untersucht.
Die Aufklärung der essentiellen Wirtsfaktoren des RVFV und die Erkenntnisse darüber, welcher Infektionsschritt des RVFV von bestimmten Wirtsfaktoren abhängt, werden zur Identifizierung potenzieller antiviraler Wirkstoffe gegen RVFV führen.

Teilprojekt Gießen

Verbundprojekt „Infect-ERA - 2. Call - FunComPath: Aufklärung des Kommensale-zu-Pathogenität-Wechsels von Candida albicans“

Jedes Jahr erkranken Milliarden Menschen an Pilzinfektionen. Die Zahl der Todesfälle ist dabei vergleichbar mit der von Tuberkulose und Malaria. Im Verbundprojekt FunComPath wird die Infektion mit dem Pilz Candida albicans näher erforscht. Dieser ist für die meisten Menschen ein unschädlicher (Mit-)Bewohner der Hautoberfläche und der Schleimhäute. Ist das körpereigene Abwehrsystem allerdings durch Krankheit oder Medikamenteneinnahme geschwächt, breitet sich der Pilz gefährlich aus und kann z.B. Nagel- oder Scheidenpilz verursachen. Auch bei einer Störung der Darmflora durch Antibiotika können dann Krankheiten ausgelöst werden. Sind bei einem Pilzbefall innere Organe betroffen, verläuft die Infektion in rund der Hälfte der Fälle sogar tödlich.
Das internationale Projektkonsortium, zu dem neben den deutschen Partnern auch Forschungsgruppen aus Spanien, Frankreich und Schweden gehören, wird den Übergang des Pilzes Candida albicans von der üblichen Koexistenz zum krankheitserregenden Zustand beim Menschen untersuchen. Ein besonderes Augenmerk liegt dabei auf der schützenden Rolle von probiotischen Mikroben. Auch anhand von Modellen der Infektion und Koexistenz sollen die entscheidenden Prozesse in Candida albicans identifiziert werden.
Es wird erwartet, dass die Ergebnisse neue Wege für vorbeugende oder therapeutische Ansätze bei Patienten eröffnen. Dies könnten die Stabilisierung des normalen koexistierenden Zustands zwischen Pilz und Mensch, die Hemmung des Übergangs zur gesundheitsgefährdenden Infektion oder die Stimulierung der Rückkehr zur Koexistenz sein.

Teilprojekt Jena

Teilprojekt Düsseldorf

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - hepBccc: Wirtsfaktoren in der Hepatitis B Virus cccDNA-Biogenese als neue antivirale Ziele und Biomarker“

Der Verbund hepBccc besteht aus einem deutschen, drei französischen, einem belgischen und einem polnischen Partner. Das Vorhaben wird vom deutschen Projektpartner koordiniert und beschäftigt sich mit chronischen Hepatitis B Virus (HBV)-Infektionen, durch die schwere Leberschäden verursacht werden können. Derzeitige Therapien sind nicht heilend, da sie das Persistenzreservoir des Virus, die cccDNA, nicht angreifen. cccDNA ist eine besondere DNA-Struktur, die während der Vermehrung einiger Viren im Zellkern der Wirtszelle auftritt und dort dauerhaft verbleiben kann. Deren nachgewiesene Bildung aus Vorläuferstrukturen ist nicht gänzlich verstanden, involviert laut neuen Ergebnissen jedoch die DNA-Reparaturmaschinerie der Wirtszelle. Übergeordnetes Ziel des Projektes ist die Identifizierung von Therapie-Ansatzpunkten und hieraus die Entwicklung heilender Therapien der chronischen Hepatitis B.
Der deutsche Teilpartner des transnationalen Verbundprojektes ist an allen Arbeitsschritten des Projektes beteiligt und wird vor allem spezielle cccDNA-Zelllinien zur Verfügung stellen, diese gegebenenfalls anpassen sowie neue, infektionsbasierte cccDNA-Testsysteme für Hochdurchsatz-Screenings weiterentwickeln. Hierzu werden ebenfalls biochemische Faktoren der Wirtszellen zur Analyse im Hochdurchsatz-Screening künstlich hergestellt, um Faktoren als Ansatzpunkt für eine mögliche Therapie zu identifizieren. Hierüber identifizierte Faktoren werden abschließend funktionell in etablierten und neuen Zellkultursystemen validiert.

Teilprojekt Freiburg

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - PROANTILIS: Pro- und antiinflammatorische Signale fördern die Infektion durch Listeria monocytogenes“

Der Verbund PROANTILIS besteht aus einem deutschen, einem israelischen, einem portugiesischen und zwei französischen Partnern. Das Vorhaben wird vom deutschen Projektpartner koordiniert und beschäftigt sich mit der Infektionskrankheit Listeriose. Diese entsteht meist durch den Erreger Listeria monocytogenes, der durch Lebensmittel aufgenommen wird. Listeriose kommt beim Menschen vor allem bei Schwangeren bzw. deren ungeborenen Kindern, bei Neugeborenen, bei alten Menschen und bei Menschen mit einer geschwächten Immunabwehr vor. Die Infektion führt zu schweren Komplikationen und endet häufig tödlich. Die Zahl der Listeriosen mit teils tödlichem Ausgang ist in den letzten Jahren in Europa angestiegen.
Ziel dieses Projektes ist es, von L. monocytogenes abgegebene RNA-Moleküle zu isolieren, zu identifizieren und deren Rolle in Immunantwort und für Zellstress des Wirtes zu untersuchen. Weiterhin soll auch ein bestimmtes, in das Wachstum und Überleben von Zellen involviertes Protein (NR4A1) auf seine dahingehende Funktion erforscht werden. Bekannt ist, dass dieses Protein in anderem Zusammenhang und bei Fehlfunktion (z.B. bei Infektionen) entzündungs- und krebsfördernde Wirkung haben kann. Ein weiteres Ziel des Vorhabens ist es, die durch das Protein Listeriolysin O aktivierte Signalübertragung in Kontext zu pro- und anti-entzündlichen Immunantworten des Wirtes zu bringen. Es wird erwartet, dass die Ergebnisse neue Therapiestrategien ermöglichen werden.

Teilprojekt Gießen

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - EUGENPATH: Infektionen und Umwelteinflüsse auf den Stoffwechsel von Mikroben, molekularer Mechanismus und Strategien ihrer Pathogenität“

Der Verbund EUGENPATH besteht aus zwei deutschen, zwei französischen, einem israelischen und einem österreichischen Partner. Das Vorhaben wird vom deutschen Projektpartner koordiniert und beschäftigt sich mit dem Umweltbakterium Legionella pneumophila, das sich in einer spezifischen "Pathogen-Vakuole" sowohl innerhalb von Amöben aber auch in Zellen (Makrophagen) des menschlichen Immunsystems vermehrt. Hierdurch kann u.a. die Legionärskrankheit, eine schwere Lungenentzündung, ausgelöst werden.
Im Verlauf ihrer Evolution haben Legionellen von Amöben "fremde" Gene erworben und in ihr Genom integriert. Die entsprechenden Produkte dieser erworbenen Gene wirken manipulierend auf zellbiologische Prozesse, auch auf jene der menschlichen Wirtszellen. Die evolutionäre Anpassung der Bakterien an Amöben ist unter anderem Voraussetzung für ihre Vermehrung in menschlichen Makrophagen und Ursache ihrer Pathogenität. Daher soll die Bedeutung der Genprodukte für die krankheitserregende Wirkung, den Stoffwechsel und die Ökologie der Legionellen durch dieses Projekt untersucht werden. Ebenfalls wird die Bildung der Pathogen-Vakuole genetisch, biochemisch und zellbiologisch in Amöben (Acanthamoeba, Dictyostelium) und menschlichen Zellen (Makrophagen, Epithelzellen) analysiert. Abschließend wird die Resistenz gegen eine Infektion mit Legionellen während Ko-Infektionen mit Symbionten in Amöben untersucht. Innerhalb des Gesamtprojektes analysiert hierbei das Teilprojekt der Ludwig-Maximilians-Universität München vor allem die Bildung der Pathogen-Vakuole bei der Vermehrung des Bakteriums innerhalb der infizierten Wirtszelle sowie den Stoffwechsel der Legionellen. Das Teilprojekt der Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald befasst sich mit der Charakterisierung und Identifizierung der Proteine des Pathogens sowie die das Pathogen umgebenden Vakuolen.
Das Vorhaben wird die Mechanismen von parasitären Interaktionen zwischen Legionellen und Wirtszellen aufklären und damit die nötigen Voraussetzungen schaffen, um neue prophylaktische und therapeutische Ansätze zu entwickeln.

Teilprojekt München

Teilprojekt Greifswald

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - CINOCA: Co-Infektion als Ursache von Ovarialkarzinomen“

Der Verbund CINOCA besteht aus drei deutschen, einem österreichischen, einem schwedischen und einem assoziierten Partner aus England. Das Vorhaben wird vom deutschen Projektpartner koordiniert und hat zum Ziel, ein vertieftes Verständnis des Zusammenhangs von Infektionen des humanen Eileiters und sich hieraus entwickelnden Krebserkrankungen zu erlangen. Chlamydia trachomatis (Chlamydien) kann in infizierten Zellen Humane Herpesviren (HHV) aktivieren und umgekehrt kann HHV eine dauerhafte Infektion mit Chlamydien fördern. Das Verbundprojekt untersucht daher die Hypothese, ob eine Co-Infektion mit diesen zwei Pathogenen das Risiko einer bösartigen Zellveränderung erhöht. In diesem Zusammenhang sollen auch die Mechanismen berücksichtigt werden, welche bei derartigen Co-Infektionen in den menschlichen Wirtszellen durch eine Änderung des genetischen (Gen) und epigenetischen (Aktivierbarkeit eines Gens) Programms der Wirtszellen zu einer Krebsentstehung führen können.
Zunächst werden umfassende Untersuchungen zu den genetischen, epigenetischen und phänotypischen Veränderungen nach der Infektion bzw. Co-Infektion von menschlichen Zelllinien mit den genannten Erregern durchgeführt. Des Weiteren werden in vitro Modelle zur Infektion von normalen menschlichen Eileiter-Primärzellen mit den Erregern entwickelt, um die langfristigen Auswirkungen auf das Genom der menschlichen Zellen zu erforschen und umfassende Analysen der genetischen und epigenetischen Veränderungen durchzuführen. Die Beobachtungen aus in vitro und ex vivo Analysen werden in vivo mit dem Ziel adressiert, eine unvoreingenommene Bestätigung der Beobachtungen zu erhalten. Hieraus sollen dann die menschlichen Krankheitsausprägungen identifiziert werden, die von Relevanz sind. Der Aufgabenschwerpunkt des Teilprojekts des Max-Planck-Instituts für Infektionsbiologie fokussiert hauptsächlich auf die genetische und epigenetische Analyse der infektionsbedingten Genom-Veränderungen und die Etablierung der verschiedenen Zellkulturen. Das Teilprojekt der Julius-Maximilians-Universität Würzburg beschäftigt sich mit genetischen Analysen zur viralen Infektion sowie zum Nachweis der Infektion in den angelegten Zellkulturen. Innerhalb des Teilprojekts des Steinbeis-Innovationszentrums wird die Interpretation der generierten DNA-Sequenzierungsdaten von verschiedenen Teilprojekten vergleichend durchgeführt, um belastbare Aussagen zu Unterschieden und Ähnlichkeiten zwischen den in vitro und in vivo Daten über die epigenetischen und genetischen Veränderungen zu erhalten.
Das Vorhaben wird wichtige Informationen zum ursächlichen Zusammenhang zwischen chronischen FT-Infektionen und Eierstockkrebs liefern, die für die Vorbeugung gegen diese wichtige Krebserkrankung genutzt werden können und Hinweise auf die Pathogenese auch anderer Krebsarten beim Menschen liefern werden.

Teilprojekt Berlin

Teilprojekt Würzburg

Teilprojekt Falkensee

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - AspMetNet: Systematische Identifizierung von Ansatzpunkten antifungaler Substanzen durch metabolische Netzwerkmodellierung“

Der transnationale Verbund AspMetNet besteht aus zwei deutschen, einem österreichischen und einem israelischen Partner. Das Vorhaben unter Koordination der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg hat sich zum Ziel gesetzt, neue Angriffspunkte für Therapien gegen krankheitserregende Pilze zu identifizieren. Das Hauptaugenmerk liegt dabei auf den Pilz-Stoffwechselwegen, da sie das Wachstum und Überleben des Pilzes im menschlichen Wirt sichern. Der Verbund untersucht hierfür den allgegenwärtigen und unter gewissen Umständen für Menschen mit geschwächtem Immunsystem krankheitsverursachenden Schimmelpilz Aspergillus fumigatus als Modellsystem. Die dabei gewonnenen Erkenntnisse sollen letztendlich auch auf andere krankheitserregende Pilze übertragen werden, um universelle Ansatzpunkte für die Entwicklung neuartiger Medikamente zu finden.
Mittels einer Hochdurchsatzmethode werden alle aktiven Genen (Transkripte) des Modellerregers A. fumigatus ermittelt. Auf Grundlage dieser Daten entwickelt der Verbund ein Netzwerkmodell des Grundstoffwechsels des Schimmelpilzes. Mit diesem Modell können die Wissenschaftler eine Vorhersage darüber treffen, welche Gene den Stoffwechsel bestimmen. In einer anschließenden funktionellen Analyse von entsprechenden gentechnisch veränderten Pilzstämmen sollen diese Kandidaten verifiziert und charakterisiert (phänotypisiert) werden. Die dabei erhobenen Daten werden nach erweiterten Transkriptom-Profilstudien zur Optimierung des Netzwerkmodells des Stoffwechsels verwendet und ermöglichen somit, weitere Gen-Kandidaten zu bestimmen. Die eingehende Charakterisierung dieser Kandidaten und der Vergleich mit anderen krankheitserregenden Pilzen soll schließlich aussichtsreiche Angriffspunkte (speziell Zielproteine) für Therapien liefern.

Teilprojekt Erlangen

Teilprojekt Würzburg

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - Abir: Identifikation molekularer und zellulärer Signalübertragungswege der Immunität gegen intrazelluläre bakterielle Erreger und Entwicklung therapeutischer Werkzeuge“

Der Verbund Abir besteht aus zwei deutschen, einem israelischen und einem französischen Partner. Das Vorhaben unter Koordination des Deutschen Rheuma-Forschungszentrums Berlin beschäftigt sich mit einem vertieften Verständnis des Zusammenspiels zwischen dem Immunsystem des Wirts und den Erregern einer Listerien- oder Salmonelleninfektion. Bekannt und akzeptiert ist, dass mononukleäre Phagozyten, sowie T- und B-Zellen des menschlichen Immunsystems eine kritische Rolle bei der Wirtsabwehr während der Infektion spielen. Das Wissen darüber, wie dieses zelluläre Netzwerk des Immunsystems bei der Kontrolle der Infektion zusammenwirkt ist jedoch noch immer lückenhaft.
Um mehr Verständnis zu den molekularen Mechanismen zu erlangen, mit denen bestimmte Zellen des Immunsystems das Bakterienwachstum in vivo hemmen, wird ein neuartiges Mausmodell entwickelt. Gemeinsam durchgeführte Untersuchungen lassen erwarten, dass neuartige Mechanismen der bakteriellen Makrophagenaktivität (bestimmte „Fresszellen“) in situ, am Ort der Infektion, aufgedeckt werden. Es werden spezifische Bakterienstämme erzeugt mit denen vergleichende Makrophagenuntersuchungen bei Salmonellen- und Listerien-infektionen durchgeführt werden. Danach werden IL-10/IL-35 defiziente Mäuse mit virulenten Salmonellen infiziert und der Infektionsverlauf untersucht um festzustellen, ob und wie B-Zellen die Immunität bereits in der mukosalen Infektionsphase beeinflussen. Schließlich werden die Studien im Humansystem verifiziert (in vitro Untersuchungen an verschiedenen dendritischen Zellen von humanen Spendern, die mit Listerien bzw. Salmonellen infiziert werden). Parallel hierzu werden in vivo Experimente an humanisierten Mäusen durchgeführt, um den Einfluss von B-Zellen auf humane Myeloid-Zellen zu studieren.
Die Arbeiten im Rahmen von Abir werden direkt Eingang in der Diagnostika- und Vakzineentwickung sowie der generellen Erarbeitung und Verbesserung rationaler Interventionsstrategien gegen Infektionskrankheiten finden.

Teilprojekt Berlin I

Teilprojekt Berlin II

Verbundprojekt „Infect-ERA - 1. Call - Haplo-Infect: Analyse der Erkennungsmechanismen von Bakterien in menschlichen Zellen unter Verwendung haploider Genetik und CRISPR-vermittelter Genom-Editierungstechnologie“

Der Verbund besteht aus zwei deutschen, zwei österreichischen, einem schwedischen und einem französischen Partner. Das Vorhaben unter österreichischer Koordination beschäftigt sich mit adjuvanten (unterstützenden) Immuntherapien zur Bekämpfung von bakteriellen Infektionskrankheiten. Die exakten Mechanismen der Erkennung von bakteriellen Keimen durch das angeborene Immunsystem des Menschen sind bisher nur unzureichend bekannt. Vor dem Hintergrund dramatisch steigender Antibiotika-Resistenzen soll dieses Projekt neue Erkenntnisse liefern, die zur Verbesserung von Therapien beitragen.
Mit Hilfe eines einzigartigen Ansatzes soll im Rahmen des Verbundprojekts eine Genom-weite Suche in menschlichen Immunzellen durchgeführt werden. Hierzu wird eine humane haploide Zelllinie (anders als in normalen Körperzellen ist hier der Genomsatz nur in einer einzigen Ausprägung vorhanden) verwendet und die mittels "genetrap"-Mutagenese erzeugten Mutanten hinsichtlich ihrer antibakteriellen Funktion untersucht. So sollen molekulare Zielstrukturen identifiziert und anhand der humanen "genetrap"-Mutanten-Sammlung verifiziert werden. Darüber hinaus werden gezielt Gene in relevanten Immunzellen inaktiviert („genome editing“). Hierbei identifiziert das Teilprojekt der Charité Berlin die entsprechenden zellulären Komponenten, die der Erkennung von lebenden Bakterien dienen sollen. Im Teilprojekt des Helmholtz-Zentrums für Infektionsforschung werden die Erkennungsmechanismen bakterieller Erreger durch das angeborene Immunsystem anhand des Modell-Erregers S. pyogenes analysiert.
Im Rahmen des Vorhabens soll die molekulare „Maschinerie“ entschlüsselt werden, die menschlichen Immunzellen zur exakten Bewertung infektiöser Gefahren (z.B. Erreger von Lungenentzündung und Scharlach) dient. Diese Ergebnisse sollen neue Angriffspunkte für medikamentöse Immuntherapien liefern.

Teilprojekt Berlin

Teilprojekt Braunschweig