Teilprojekt eines Verbundes

TP4: Die Nukleosomenlandschaft von Patienten mit Coffin-Siris und Nicolaides-Baraitser Syndrom und Mutationen im SWI/SNF-Komplex

Förderkennzeichen: 01GM1520B
Fördersumme: 271.800 EUR
Förderzeitraum: 2016 - 2019
Projektleitung: Dr. Nuria Brämswig
Adresse: Universität Duisburg-Essen, Universitätsklinikum Essen
Hufelandstr. 55
45147 Essen

Das Teilprojekt 4 dient der Charakterisierung der epigenetischen Landschaft von Patienten mit Coffin-Siris Syndrom und Patienten mit Nicolaides-Baraitser Syndrom. Obwohl bereits gezeigt werden konnte, dass beide Krankheiten von Mutationen im "switch/sucrose nonfermenting" (SWI/SNF)-Komplex verursacht werden, sind die zugrundeliegenden molekularen Mechanismen noch nicht bekannt. In diesem Teilprojekt werden die epigenetischen Profile von Kontrollpersonen, Patienten mit Coffin-Siris Syndrom und Patienten mit Nicolaides-Baraitser Syndrom analysiert und dann miteinander verglichen, um krankheitsrelevante Veränderungen auf Nukleosomebene zu identifizieren. Die Erhebung der genomweiten Nukleosom- und DNA-Methylierungsprofile erfolgt mittels "Nucleosome Occupancy and Methylation" (NOMe)-Sequenzierung. In einem nächsten Schritt werden ausgewählte Regionen mit Nukleosomveränderungen mittels Amplikon-Analyse validiert. Weiterhin ist eine Korrelation der hier gewonnenen epigenetischen Profile mit den Genexpressionsprofilen und den Genomsequenzierungen aus anderen Teilprojekten im Verbund vorgesehen.