Teilprojekt eines Verbundes

Standort Heidelberg DKFZ

Förderkennzeichen: 01KU1505A
Fördersumme: 924.154 EUR
Förderzeitraum: 2015 - 2017
Projektleitung: Prof. Dr. Peter Lichter
Adresse: Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ), Abt. Molekulare Genetik
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg

In diesem Vorhaben (Teilprojekt (TP)2 und TP3) werden, neben koordinativen Aufgaben, weiterführende bioinformatische Analysen an den vorhandenen Datensätzen auf den Ebenen, Genom, Transkriptom, Methylom und Chromatin, durchgeführt. Dabei werden die Analysen sowohl Entitäten-spezifisch als auch Entitäten-übergreifend durch Integration der Hochdurchsatzdaten durchgeführt. In TP2, Arbeitspaket (AP)3 findet die Analyse des Epigenoms an den Prostatakarzinomdatensätzen statt. Die integrierte Datenanalyse von genomischen Aberrationen, Methylom- und Transkriptom-Daten erfolgt in AP4. In TP3, AP1 findet die Teilprojekt-Koordination statt. In TP3, AP2 werden Analysen durchgeführt, um neue Enhancer und deren Zielgene, die selektiv in verschiedenen pädiatrischen Hirntumoren aktiv sind, zu finden. Transkriptomanalysen und speziell lange nicht-kodierenede RNA, alternative Promotoren, alternativ gesplicte Transkripte werden in TP3, AP3 sowie Analysen der Chromatinlandschaft in pädiatrischen Hirntumoren werden in AP4 analysiert. In TP3, AP5 findet die Integration der Daten (Hirntumoren) in enger Zusammenarbeit mit der übergreifenden Integration der Hochdurchsatzdaten statt.