Einzelprojekt

Oncologics - Computergestützte Modellierung und eine funktionelle Validierungsplattform für personalisierte klinische Therapieentscheidungen beim kolorektalem Karzinom

Förderkennzeichen: 01KU2106
Fördersumme: 298.005 EUR
Förderzeitraum: 2021 - 2024
Projektleitung: Prof. Dr. Christine Sers
Adresse: Charité, Universitätsmedizin Berlin, Institut für Pathologie, AG Digitale Pathologie
Charitéplatz 1
10117 Berlin

Das Ziel von ONCOLOGICS ist die Bereitstellung einer integrierten mathematisch / bioinformatischen und experimentellen Plattform. Diese soll patientenspezifische Logikmodelle zusammen mit korrespondierenden Organoidmodellen und zielgerichteten Therapietests nutzen, um aus einer großen Anzahl möglicher medikamentöser Behandlungsschemata diejenigen Ansätze auszuwählen, die für einen individuellen Patienten die höchste Wirksamkeit erzielen können. Die Ziele der Arbeitsgruppen an der Charité sind die Erstellung/Verbesserung von in silico-Modellen, mit denen zukünftig Patienten-spezifisch das Therapieansprechen simuliert werden kann. Hierfür werden aus den mehr als 350 an der Charité vorliegenden Datensätzen zu Kolonkarzinom solche Patientinnen und Patienten ausgewählt, die molekular und klinisch gut charakterisiert sind, für die ggf. Organoid-Modelle vorliegen oder ähnliche Organoid-Modelle als Validierungsoption eingesetzt werden können. Anhand der Patientendaten, therapeutischer Interventionen und Einzell-Proteom-Analysen an Organoiden werden die Modelle weiter verbessert. Langfristig sollen die in silico-Modelle für das Design klinischer Studien eingesetzt werden.