Das Vorhaben hat zum Ziel, nicht-invasive epigenetische Biomarker in der Plasma-DNA von Probanden zu identifizieren, die ein hohes Risiko tragen, an einem kolorektalen Karzinom zu erkranken. Analoge Analysen sollen mit DNA-Proben von 3D-intestinalen Organoiden und Mausmodellen durchgeführt werden. Ferner sollen Mikrobiomanalysen aus Stuhlproben von Probanden Aufschlüsse über die Metagenome in bestimmten Ernährungssituationen und in Krebs-Vorläuferstufen geben. Bei den Arbeiten werden Anreicherungs-basierte Hochdurchsatz-Sequenziermethoden sowie PCR-basierte Amplifikationen variabler Regionen mikrobieller 16S rDNA, gefolgt von Multiplex-Sequenzierung, eingesetzt. Nach bioinformatischer Auswertung werden die Daten zur Priorisierung von Biomarkern genutzt, die in die Konstruktion des automatisierten Multimarker-Panels eingebracht werden.