Ziel des Greifswalder Teils des Teilprojektes A3 des Verbundes ist es, die adaptive Immundantwort auf Streptococcus pneumoniae zu charakterisieren. Dazu werden sowohl die Proteinprofile infizierender Pneumokokkenstämme unter besonderer Beachtung der Zellwand- und sekretierten Proteine charakterisiert als auch die Antikörperprofile gegen Pneumokokkenantigene in einem personalisierten Immunoproteomansatz zu einem Vergleich infizierender Stämme mit individuellen Immunantworten aufgenommen. Komplementär dazu und zusätzlich zum ursprünglich beantragten Arbeitsprogramm wird im Auftrag des ganzen Konsortiums das Proteomprofiling von 560 humanen Plasmaproben ausgeführt, um diese Daten zur integrierten Biomarkersuche gemeinsam mit den Immunoproteom und Transkriptomdaten einsetzen zu können. Aufbauend auf die phänotypische und genotypische Charakterisierung von klinischen Pneumokokkenisolaten werden aus den Proteinfraktionen dieser Stämme durch eine Kombination von 2-D Elektrophorese und Massenspektrometrie Proteomreferenzkarten erstellt, um dann mit gelbasierten Immuno-proteomanalysen immundominante Proteine zu identifizieren. Kandidatenproteine werden dann mit der Luminextechnologie in größeren Probenkollektionen validiert. Komplementär erfolgt mit einem in Greifswald etablierten Proteomicsworkflow die Charakterisierung von 560 humanen Plasmaproben von Patienten, wobei der Fokus auf der Identifizierung mit dem Übergang zwischen verschiedenen Lungenentzündungs-Schweregraden assoziierten Proteomveränderungen liegt.