Teilprojekt eines Verbundes

Optimierte Verfahren des Next-Generation Sequencing bei Zoonoseerregern, - Bioinformatische Herausforderungen und Kontaminanten

Förderkennzeichen: 01KI1905D
Fördersumme: 111.616 EUR
Förderzeitraum: 2020 - 2021
Projektleitung: Prof. Dr. Bernhard Renard
Adresse: Hasso-Plattner-Institut für Digital Engineering gGmbH
Prof.-Dr.-Helmert-Str. 2-3
14482 Potsdam

Übergeordnetes Ziel des Verbundprojekts ist die Vernetzung der verschiedenen Zoonose-Verbünde, um aufbauend auf den diversen Erfahrungen der verschiedenen Verbünde und Institute innerhalb der Verbünde auf dem Gebiet der Next-Generation-Sequencing (NGS)-Technologie technologische und methodische Fortschritte zu erreichen. Ziel dieses Arbeitspakets ist daher der Aufbau einer entsprechenden Infrastruktur zur Sammlung von Falschpositiven in Kontakt mit entsprechenden Sequenzierlaboren. In einer Pilotstudie am RKI wurden bereits für diese Vorhaben zentrale Arbeitsschritte definiert. Diese Vorkenntnisse sind als Startpunkt für die hier vorgesehenen Entwicklungen verfügbar. Die zu entwickelnden dynamischen Sammlungen bekannter oftmals auftretender falsch-positiver Treffer werden ebenfalls netzwerkintern verfügbar gemacht.