Teilprojekt eines Verbundes

Expansion und Infektion im S3-biologischen Sicherheitsbereich und Statistische Einzelzellanalyse

Förderkennzeichen: 01KI20169B
Fördersumme: 203.129 EUR
Förderzeitraum: 2020 - 2021
Projektleitung: Dr. Benjamin Schubert
Adresse: Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH), Institute of Computational Biology (ICB)
Ingolstädter Landstr. 1
85764 Neuherberg

Ziele des Verbundprojekts sind: 1) Aufklärung der Regulation des Virus-Eintritts und dessen pharmazeutische Kontrolle. 2 Mechanismus und Wirtsantwort von Atemwegszellen nach SARS-CoV2 Infektion. 3) Untersuchung bereits existierender Medikamente und deren Einfluss auf epitheliale Biologie und Virusreplikation. Ziel des Teilvorhabens ist die Etablierung einer bioinformatischen Einzelzellanalyse-Pipeline zur Detektion von RNA-Virus infizierten Zellen sowie die statistische Analyse der anfallenden Einzelzelldaten zur Charakterisierung von SARS-CoV-2 induzierten Veränderung des Transkriptoms mit und ohne ACE2 Inhibitoren und detaillierte Charakterisierung der Differnzierungstrajektorien von Epithelzellen in 3D-ALI-Kulturen. Explizites Ziel des Teilvorhabens ist außerdem, den Einfluss bereits existierender und zugelassener Medikamente auf die Expression des Virusaufnahmerezeptors ACE2 und damit auf die epitheliale Biologie, die Virusreplikation und Neuinfektion zu untersuchen.