Verbund

Deep Insight – Integration von Keimbahn- und somatischen genetischen Profilen durch maschinelles Lernen zum Verständnis der Ätiologie von Speiseröhrenkrebs

Das Verbundprojekt Deep Insight beschäftigt sich mit der Erforschung der genetischen Entstehungsmechanismen sowie mit Verbesserungen der Therapieoptionen von Speiseröhrenkrebs. Diese Krebsart weist steigende Fallzahlen in den Industrieländern auf, wird häufig jedoch zu spät diagnostiziert und hat nur sehr geringe Heilungschancen. Man unterscheidet beim Speiseröhrenkrebs zwei verschiedene Karzinome, von denen das sogenannte ösophageale Adenokarzinom (EAC) etwas häufiger auftritt. Es wird vermutet, das ein EAC unter anderem mit Veränderungen der Speiseröhren-Schleimhaut infolge von Reflux in Zusammenhang steht. Für eine Diagnose wird zumeist eine Endoskopie der Speiseröhre durchgeführt.

Hier setzt Deep Insight an: Im Rahmen des Projekts soll mittels des Einsatzes von maschinellem Lernen, künstlicher Intelligenz und großer Omics-Datensätze eine spezielle Analysesoftware entwickelt und validiert werden. Diese soll in der Lage sein, Vorhersagen zum Verlauf von EAC-Vorstadien zu erstellen. Es ist geplant, die entwickelte Analysesoftware mittels eines Open Source-Ansatzes im Rahmen der Bioinformatik-Cloud de.NBI Anwenderinnen und Anwendern zur Verfügung zu stellen.

Im Erfolgsfall ließe sich die entwickelte Methodik gut in den Klinikalltag überführen, so dass Patientinnen und Patienten mit EAC-Vorstufen künftig auch ohne aufwändige endoskopische Überwachung besser monitoriert werden könnten. Zusätzlich ließe sich mit der Analyse-Software die beste individuelle Behandlungsoption für die jeweilige EAC-Patientin bzw. -Patienten ermitteln.

Teilprojekte

Teilprojekt Marburg

Förderkennzeichen: 031L0267A
Gesamte Fördersumme: 484.326 EUR
Förderzeitraum: 2021 - 2024
Projektleitung: Prof. Dr. Dominik Heider
Adresse: Philipps-Universität Marburg - Fachbereich Mathematik und Informatik
Biegenstr. 10
35037 Marburg

Teilprojekt Marburg

Teilprojekt Köln

Förderkennzeichen: 031L0267B
Gesamte Fördersumme: 415.710 EUR
Förderzeitraum: 2021 - 2024
Projektleitung: Prof. Dr. Axel Hillmer
Adresse: Universität zu Köln - Medizinische Fakultät - Institut für Pathologie
Kerpener Str. 62
50937 Köln

Teilprojekt Köln