Teilprojekt eines Verbundes

Proteine und Elektrophysiologie

Förderkennzeichen: 01KI1827B
Fördersumme: 300.803 EUR
Förderzeitraum: 2019 - 2022
Projektleitung: Prof. Dr. Mathias Winterhalter
Adresse: Jacobs University Bremen gGmbH
Campus Ring 1
28759 Bremen

Effluxpumpen sind ein wichtiger Faktor für die Medikamentenresistenz bei Gram-negativen Bakterien. In E. coli transportiert zum Beispiel der AcrAB-TolC-Komplex Antibiotika aus dem Periplasma oder Zytoplasma in das externe Medium. In diesem Konsortium wurde über eine Kombination von einem virtuellen Screening und experimenteller Validierung der in silico-Hits durch Oberflächenplasmonresonanz-Messungen (SPR) sowie elektrophysiologische Studien eine organische Substanz identifiziert, welche die TolC-Funktion effektiv blockiert. Aufbauend auf diesen Ergebnissen soll diese Verbindung weiterentwickelt und parallel dazu neuartige TolC-Blocker  identifiziert weiterentwickelt werden. Der bereits bekannte Blocker wird in drei Optimierungsrunden weiterentwickelt. Jede Runde umfasst Substanzmodifikationen durch medizinalchemische Methoden, die Beurteilung der TolC-Bindung und -Blockierung durch Oberflächenplasmonresonanz und Elektrophysiologie, sowie verschiedene antimikrobielle Studien und ADMETox-Profile. Die Aufgabe des Teams an der Jacobs University ist es, die notwendigen Membranproteine zu produzieren und geeignete Mutanten zur Überprüfung der Bindung herzustellen und die Substanzen elektrophysiologisch zu charakterisieren.