Teilprojekt eines Verbundes

Transkriptomik und Proteomik

Förderkennzeichen: 01ZX1910B
Fördersumme: 719.228 EUR
Förderzeitraum: 2019 - 2022
Projektleitung: Prof. Dr. Stefan Kalkhof
Adresse: Fraunhofer-Institut für Zelltherapie und Immunologie (IZI)
Perlickstr. 1
04103 Leipzig

Die Vision von SyMBoD ist die Schaffung einer digitalen Plattform mit Theranostik-Funktion. Sie dient Klinikern bei der Entscheidungsfindung für eine regenerative Knochentherapie. Unsere Vision basiert auf der Hypothese, dass bei Pseudarthrose- und Typ-2-Diabetes mellitus (T2DM)-Komorbidität zur Heilung personalisierte, intelligente Gerüstkonstruktionen eingesetzt werden können. Zur Realisierung arbeiten wir an spezifischen Zielen, die in 5 Teilprojekten (TP) erreicht werden. Ziel TP1: Aufklärung des Potenzial von additiv hergestellten Implantaten mit optimierten biophysikalischen und mechanischen Eigenschaften für die Knochenregeneration femoraler Segmentdefekte in einem T2DM-Rattenmodell. Ziel TP2: Errichtung einer Biobank für T2DM-Patienten mit/ohne Knochendefekt. Die aus TP1 und TP2 gesammelten Proben werden mit Multi-Omics-Technologien und Bioinformatik-Methoden in TP3 analysiert, um ein umfassendes, zeitaufgelöstes und aussagekräftiges molekulares Profil bereitzustellen (Metabolit, Protein und RNA). Diese mechanistischen Profile werden eine verbesserte Stratifizierung von Patienten ermöglichen und sind für die Entwicklung von In-Silico-Tools hilfreich, um in TP4 den computergestützten Design- und Engineering-Workflow (CADE) für die Erstellung personalisierter Knochengerüste zur Unterstützung der Knochenregeneration zu vereinfachen. In TP5 wird eine digitale Plattform mit Theranostik-Fähigkeiten geschaffen, welche klinische und Forschungsdaten sowie mathematische und rechnergestützte Modelle integriert.